Estonska nogometna reprezentacija predstavlja Estoniju u sportu nogometu. Domaće utakmice igraju na A. Le Kok Areni u Tallinnu. Prvu utakmicu je igrala 1920. godine protiv Finske. Najbolji uspjeh na FIFA-inoj rang-ljestvici imala je u prosincu 2002. godine, kada je bila 60., a najlošija je bila u listopadu 2008., kada je bila 137.
Nakon proglašenja nezavisnosti, Estonija je bila najslabija od tri baltičke zemlje, trpjela je teške poraze kao onaj protiv Hrvatske, 7:1, u kvalifikacijama za Euro '96. U kvalifikacijama za Svjetsko prvenstvo 1998. u Francuskoj, dogodila se nesvakidašnja situacija - estonska reprezentacija se nije pojavila na utakmici sa Škotskom. Ponovljena utakmica završila je 0:0. U kvalifikacijama za Euro 2004. Estonija je osvojila 8 bodova iz isto toliko utakmica, s 4 postignuta i 6 primljenih pogodaka. Kvalifikacije za Svjetsko prvenstvo 2006. donijele su značajan napredak, reprezentacija je ostvarila 5 pobjeda, 2 neriješena rezultata i 5 poraza.
Nekoliko igrača, kao Mart Poom, Andres Oper, Marko Kristal i Martin Reim, su ostvarili više od 100 nastupa za nacionalni sastav. Jedan od najvećih rezultata u povijesti estonskog nogometa dogodio se 8. listopada2010. godine, kada su pobijedili reprezentaciju Srbije u gostima 3:1, čime su značajno ugrozili šanse te reprezentacije za plasmanom na Euro 2012.