Prvenstvo se igralo trokružno. Nakon 21. kola prvak 3. ŽNL Vukovarsko-srijemske NS Vukovar je postala NK Sloga Pačetin. Pored nje, u viši rang, odnosno 2. ŽNL Vukovarsko-srijemsku NS Vukovar su se plasirali i drugoplasirani NK Negoslavci.
- ↑1 Utakmica odigrana 30. kolovoza 2008. godine
- ↑2 Utakmica odigrana 6. rujna 2008. godine
- ↑3 Utakmica odigrana 20. rujna 2008. godine
- ↑4 Utakmica odigrana 4. listopada 2008. godine
- ↑5 Utakmica odigrana 18. travnja 2009. godine
- ↑6 Utakmica odigrana 25. travnja 2009. godine
- ↑7 Utakmica prekinuta u 81. minuti
- ↑8 Utakmica odigrana 16. svibnja 2009. godine
- Arhiva Vukovarskih novina (1. svibnja 2009.) Arhivirana inačica izvorne stranice od 13. ožujka 2021. (Wayback Machine)
- Vinkovački list #2824, rezultati 1. kola
- Vinkovački list #2825, rezultati 2. kola
- Vinkovački list #2826, rezultati 3. kola
- Vinkovački list #2827, rezultati 4. kola
- Vinkovački list #2828, rezultati 5. kola
- Vinkovački list #2829, rezultati 6. kola
- Vinkovački list #2830, rezultati 7. kola
- Vinkovački list #2831, rezultati 8. kola
- Vinkovački list #2832, rezultati 9. kola
- Vinkovački list #2833, rezultati 10. kola
- Vinkovački list #2854, rezultati 11. kola
- Vinkovački list #2855, rezultati 12. kola
- Vinkovački list #2856, rezultati 13. kola
- Vinkovački list #2857, rezultati 14. kola
- Vinkovački list #2858, rezultati 15. kola
- Vinkovački list #2859, rezultati 16. kola
- Vinkovački list #2860, rezultati 17. kola
- Vinkovački list #2861, rezultati 18. kola
- Vinkovački list #2862, rezultati 19. kola
- Vinkovački list #2863, rezultati 20. kola
- Vinkovački list #2864, rezultati 21. kola