3. ŽNL Vukovarsko-srijemsku je u sezoni 2000./01. činilo 15 klubova iz Vukovarsko-srijemske županije podijeljenih u dvije grupe. Pobjednici grupa bi igrali finale čime bi bio odlučen prvak lige, odnosno klub koji će biti promoviran u 2. ŽNL Vukovarsko-srijemsku. Iz lige nitko nije ispadao, jer je 3. ŽNL Vukovarsko-srijemsku najniži rang natjecanja.
Prvenstvo i promociju u 2. ŽNL Vukovarsko-srijemsku su osvojili NK Marinci nakon finalnog meča s NK Sremac Markušica.
Finalna utakmica prvenstva odigrana je 3. lipnja 2001. godine na Gradskom stadionu u Vukovaru između pobjednika grupa NK Sremac Markušica i NK Marinci. Utakmica je završena rezultatom 2:1 za NK Marince, čime su oni postali prvak 3. ŽNL i stekli promociju u 2. ŽNL.[1]
- ↑1 NK Sremac Markušica kažnjen oduzimanjem 1 boda
- ↑2 NK Budućnost Šiškovci kažnjen oduzimanjem 1 boda