Ct-vrijednost
U molekularnoj biologiji, vrijednost Ct ( engl. cycle treshold, skraćeno Ct ) je broj ciklusa u lančanoj reakciji plimerazom u stvarnom vremenu koji su potrebni da se postigne prethodno definirana granična vrijednost u mjernom signalu (npr. fluorescentni signal) umnožene DNK. Što je više DNK (RNK) već bilo prisutno u otopini uzorka prije PCR-a, to je manje ciklusa amplifikacije potrebno da se postigne odgovarajuća vrijednost praga.[1] Pod nepromjenjivim reakcijskim uvjetima, ova vrijednost omogućuje izračun količine početno prisutne DNK ili RNK, zbog čega se koristi za kvantifikaciju odgovarajućih koncentracija. U studijama ekspresije gena, broj kopija može se mjeriti u apsolutnom ili relativnom smislu u odnosu na referentni kontrolni gen.[2]
Nepromjenjivost uvjeta reakcije prisutna je samo u idealnom slučaju i općenito ovisi o različitim vanjskim čimbenicima (npr. učinkovitost reakcije, učinkovitost cijepanja ili hibridizacije, osjetljivost odgovarajućeg testa).[3] Čak i mala odstupanja u učinkovitosti PCR-a mogu snažno utjecati na rezultat.[4]
- ↑ Hans D. Bruhn. 2008. LaborMedizin: Indikationen, Methodik und Laborwerte; Pathophysiologie und Klinik. Schattauer Verlag. str. 117. ISBN 978-3-7945-2550-8
- ↑ Thomas D. Schmittgen, Kenneth J. Livak. 2008. Analyzing real-time PCR data by the comparative CT method. 3. str. 1101–1108. doi:10.1038/nprot.2008.73. ISSN 1750-2799
- ↑ Ulrich Busch. 2010. Molekularbiologische Methoden in der Lebensmittelanalytik: Grundlegende Methoden und Anwendungen. Springer-Verlag. str. 41. doi:10.1007/978-3-642-10716-0_4. ISBN 978-3-642-10716-0
- ↑ Christian Ramakers, Jan M Ruijter, Ronald H. Lekanne Deprez, Antoon F. M Moorman. 2003. Assumption-free analysis of quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) data. 339. str. 62–66. doi:10.1016/S0304-3940(02)01423-4. ISSN 0304-3940CS1 održavanje: više imena: authors list (link)